Dans son avis du 6 juillet et mis à jour le 8 juillet, le Conseil scientifique fait état de son "inquiétude grandissante" concernant le variant Delta.
"Beaucoup plus transmissible que le variant Alpha (de lignage B.1.1.7), ce variant est désormais l'objet d'une diffusion rapide dans le monde entier, notamment dans certains pays européens comme le Royaume-Uni ou le Portugal, où il provoque une reprise épidémique. Le variant Delta représente 40 % des nouvelles contaminations en France métropolitaine et sa présence est hétérogène selon les territoires.
De manière réaliste, une nouvelle vague due au variant Delta doit être collectivement anticipée. Elle ne pourra pas être complètement absorbée par le niveau élevé de la vaccination, qui reste encore insuffisant au sein de la population pour assurer une protection collective efficace. Des mesures prises maintenant peuvent limiter cette nouvelle vague et ses effets."